Rank Location Elevation Municipality Population
1 Mavrovo i Rostushe 1,230 m Poloshki 4,950
2 Centar Zhupa 1,012 m Jugozapaden 3,701
3 Resen 865 m Pelagoniski 13,957
4 Berovo 841 m Istochen 10,377
5 Debrca 780 m Jugozapaden 3,500
6 Prilep 732 m Pelagoniski 67,247
7 Ohrid 700 m Jugozapaden 50,338
8 Struga 696 m Jugozapaden 51,030
9 Chashka 686 m Vardarski 8,066
10 Kriva Palanka 680 m Severoistochen 17,499
11 Plasnica 680 m Jugozapaden 4,210
12 Delchevo 640 m Istochen 12,970
13 Dolneni 635 m Pelagoniski 13,130
14 Debar 630 m Jugozapaden 15,506
15 Krivogashtani 594 m Pelagoniski 4,949
16 Mogila 582 m Pelagoniski 5,121
17 Tearce 547 m Poloshki 17,645
18 Gostivar 535 m Poloshki 59,651
19 Rankovce 503 m Severoistochen 3,368
20 Lipkovo 450 m Severoistochen 22,834
21 Kochani 400 m Istochen 30,428
22 Jegunovce 390 m Poloshki 8,732
23 Lozovo 301 m Vardarski 2,166
24 Arachinovo 300 m Skopski 13,431
25 Shuto Orizari 297 m Skopski 26,466
26 Karbinci 290 m Istochen 3,369
27 Kumanovo 286 m Severoistochen 97,241
28 Gazi Baba 250 m Skopski 69,013
29 Chair 250 m Skopski 64,219
30 Karposh 250 m Skopski 63,143
31 Kisela Voda 250 m Skopski 60,824
32 Gjorche Petrov 250 m Skopski 44,164
33 Saraj 250 m Skopski 39,853
34 Butel 250 m Skopski 38,130
35 Centar 247 m Skopski 44,185
36 Aerodrom 244 m Skopski 77,264
37 Novo Selo 230 m Jugoistochen 6,558
38 Cheshinovo - Obleshevo 230 m Istochen 5,167
39 Veles 225 m Vardarski 47,270
40 Rosoman 166 m Vardarski 3,666

The elevation is the height above sea level given in the Wikipedia infobox, usually measured at the centre of the place – not the highest point of the municipal area. The reference level follows the respective country (Germany NHN, Austria Adriatic, Switzerland sea level).