Rank Location Elevation Province Population
1 Quijos 4,672 m Napo 6,705
2 Archidona 4,011 m Napo 33,002
3 Cayambe 3,966 m Pichincha 114,201
4 Colta 3,403 m Chimborazo 29,432
5 El Chaco 3,353 m Napo 9,662
6 El Tambo 3,295 m Cañar 9,619
7 Guamote 3,200 m Chimborazo 35,322
8 Espejo 3,190 m Carchi 14,559
9 Cañar 3,052 m Cañar 51,786
10 Rumiñahui 3,042 m Pichincha 115,523
11 Tulcán 2,939 m Carchi 95,028
12 Pujilí 2,927 m Cotopaxi 68,149
13 Saraguro 2,863 m Loja 29,462
14 Montúfar 2,853 m Carchi 30,000
15 Distrito Metropolitano De Quito 2,839 m Pichincha 2,875,075
16 Azogues 2,802 m Cañar 77,967
17 Quero 2,799 m Tungurahua 19,311
18 Latacunga 2,773 m Cotopaxi 233,899
19 Nabón 2,773 m Azuay 14,789
20 Guano 2,767 m Chimborazo 49,598
21 Riobamba 2,756 m Chimborazo 273,355
22 Sígsig 2,755 m Azuay 25,633
23 Pedro Moncayo 2,688 m Pichincha 44,099
24 Ambato 2,637 m Tungurahua 385,011
25 Biblián 2,608 m Cañar 18,695
26 Guaranda 2,591 m Bolívar 100,363
27 Cuenca 2,560 m Azuay 628,740
28 Chunchi 2,548 m Chimborazo 10,577
29 Antonio Ante 2,546 m Imbabura 57,459
30 Otavalo 2,530 m Imbabura 121,345
31 Chillanes 2,464 m Bolívar 20,366
32 Chimbo 2,448 m Bolívar 15,473
33 San Miguel 2,417 m Bolívar 28,793
34 Sevilla De Oro 2,378 m Azuay 4,525
35 Mejía 2,349 m Pichincha 109,568
36 Oña 2,343 m Azuay 3,465
37 Mira 2,337 m Carchi 12,822
38 Girón 2,316 m Azuay 12,370
39 Alausí 2,285 m Chimborazo 37,444
40 Patate 2,254 m Tungurahua 14,065
41 Celica 2,236 m Loja 14,636
42 Gualaceo 2,233 m Azuay 44,313
43 Ibarra 2,208 m Imbabura 233,297
44 Pangua 2,206 m Cotopaxi 22,839
45 Paute 2,200 m Azuay 27,331
46 Sigchos 2,169 m Cotopaxi 18,315
47 San Miguel De Urcuquí 2,162 m Imbabura 18,687
48 Cotacachi 2,099 m Imbabura 57,334
49 Loja 2,078 m Loja 259,977
50 Espíndola 1,998 m Loja 14,207
51 Pimampiro 1,965 m Imbabura 14,153
52 Paltas 1,909 m Loja 22,823
53 Gonzanamá 1,870 m Loja 12,417
54 Sucumbíos 1,822 m Sucumbíos 3,075
55 Sozoranga 1,636 m Loja 6,885
56 Calvas 1,635 m Loja 26,242
57 Piñas 1,471 m El Oro 30,304
58 Catamayo 1,373 m Loja 36,669
59 Puyango 1,312 m Loja 16,555
60 Zaruma 1,279 m El Oro 24,895
61 Yacuambi 1,277 m Zamora Chinchipe 6,625
62 Chinchipe 1,223 m Zamora Chinchipe 11,032
63 Mera 1,185 m Pastaza 16,168
64 San Miguel De Los Bancos 1,100 m Pichincha 14,037
65 Limón Indanza 1,100 m Morona Santiago 10,099
66 Santo Domingo 989 m Santo Domingo De Los Tsáchilas 475,617
67 Morona 979 m Morona Santiago 61,155
68 Santa Isabel 970 m Azuay 20,634
69 Zamora 899 m Zamora Chinchipe 32,334
70 Palora 880 m Morona Santiago 13,466
71 Gualaquiza 850 m Morona Santiago 23,842
72 Echeandía 849 m Bolívar 15,607
73 Pedro Vicente Maldonado 839 m Pichincha 16,721
74 Yantzaza 822 m Zamora Chinchipe 25,365
75 Sucúa 819 m Morona Santiago 25,274
76 Las Naves 676 m Bolívar 7,407
77 Portovelo 650 m El Oro 14,010
78 Santa Cruz 633 m Galápagos 18,232
79 Isabela 556 m Galápagos 3,300
80 Tena 521 m Napo 88,146
81 Caluma 486 m Bolívar 16,611
82 Cumandá 460 m Chimborazo 17,710
83 Macará 448 m Loja 18,440
84 Montecristi 366 m Manabí 110,453
85 Pastaza 363 m Pastaza 90,751
86 Camilo Ponce Enríquez 362 m Azuay 25,368
87 Zapotillo 325 m Loja 15,466
88 Lago Agrio 303 m Sucumbíos 107,234
89 Jipijapa 274 m Manabí 82,846
90 Francisco De Orellana 245 m Orellana 103,078
91 Sucre 242 m Manabí 68,786
92 Putumayo 229 m Sucumbíos 8,798
93 Aguarico 195 m Orellana 7,723
94 Quinindé 176 m Esmeraldas 134,325
95 Buena Fe 162 m Los Ríos 84,781
96 Valencia 159 m Los Ríos 57,147
97 Paján 149 m Manabí 44,680
98 San Cristóbal 144 m Galápagos 8,916
99 El Carmen 139 m Manabí 133,707
100 Santa Ana 126 m Manabí 54,154
101 La Troncal 112 m Cañar 68,614
102 Junín 86 m Manabí 23,868
103 Quevedo 74 m Los Ríos 230,062
104 El Empalme 64 m Guayas 87,743
105 Arenillas 43 m El Oro 34,271
106 Portoviejo 42 m Manabí 348,554
107 Colimes 42 m Guayas 28,005
108 Santa Elena 41 m Santa Elena 200,227
109 Naranjito 33 m Guayas 48,596
110 Balzar 32 m Guayas 62,970
111 Bolívar 29 m Manabí 46,121
112 Naranjal 27 m Guayas 94,031
113 Pasaje 26 m El Oro 87,408
114 Ventanas 24 m Los Ríos 80,425
115 Pedernales 21 m Manabí 82,234
116 Durán 20 m Guayas 338,431
117 Manta 20 m Manabí 294,964
118 El Guabo 18 m El Oro 64,303
119 Rocafuerte 17 m Manabí 46,720
120 Vinces 16 m Los Ríos 87,610
121 Urdaneta 15 m Los Ríos 35,753
122 Chone 14 m Manabí 137,055
123 Puebloviejo 14 m Los Ríos 46,320
124 Milagro 12 m Guayas 219,135
125 Baba 11 m Los Ríos 48,884
126 La Libertad 10 m Santa Elena 119,332
127 San Lorenzo 10 m Esmeraldas 56,300
128 Guayaquil 9 m Guayas 3,007,696
129 Machala 9 m El Oro 327,122
130 Huaquillas 8 m El Oro 60,334
131 Salinas 7 m Santa Elena 90,939
132 Santa Rosa 7 m El Oro 85,472
133 Salitre 7 m Guayas 65,712
134 Esmeraldas 6 m Esmeraldas 233,519
135 Babahoyo 6 m Los Ríos 195,686
136 Daule 4 m Guayas 251,738
137 Samborondón 4 m Guayas 111,478
138 Playas 3 m Guayas 68,083
139 San Fernando 3 m Azuay 3,701
140 Muisne 1 m Esmeraldas 39,459

The elevation is the height above sea level given in the Wikipedia infobox, usually measured at the centre of the place – not the highest point of the municipal area. The reference level follows the respective country (Germany NHN, Austria Adriatic, Switzerland sea level).